Ο Σπύρος Παπαευθυμίου γεννήθηκε το 1971 και είναι παντρεμένος με  3 παιδιά. Μεγάλωσε στο Ρίο Πατρών αλλά είναι πλέον μόνιμος κάτοικος Χανίων. Αποφοίτησε από το τμήμα Φυσικής του Πανεπιστημίου Πατρών το 1995 και στη συνέχεια έλαβε το μεταπτυχιακό και διδακτορικό του δίπλωμα από το ίδιο τμήμα το 1997 και το 2001 αντίστοιχα. Από το 2012 είναι μέλος της ακαδημαϊκής κοινότητας του Πολυτεχνείου Κρήτης, πλέον ως Αναπληρωτής Καθηγητής στη Σχολή Μηχανικών Παραγωγής & Διοίκησης. Είναι μέλος του Εργαστήριου Βιομηχανικών, Ενεργειακών και Περιβαλλοντικών Συστημάτων και ηγείται της ερευνητικής ομάδας Συστήματων και Τεχνολογιών Διαχείρισης και Εξοικονόμησης Ενέργειας.

Τα ερευνητικά του ενδιαφέροντα εστιάζονται σε διατάξεις και τεχνολογίες ευφυούς ενεργειακής διαχείρισης και εξοικονόμησης ενέργειας, με εξειδικευμένες εφαρμογές σε τομείς όπως οι λιμένες και οι περιβαλλοντικές συνέπειες των δραστηριοτήτων τους. Διδάσκει στο μεταπτυχιακό και προπτυχιακό κύκλο σπουδών της Σχολής Μηχανικών Παραγωγής & Διοίκησης, είναι μέλος διεθνών επιστημονικών οργανισμών καθώς και κριτής επιστημονικών περιοδικών και συνεδρίων. Έχει συμμετάσχει στην εκτέλεση πολλών ευρωπαϊκών και ελληνικών ερευνητικών προγραμμάτων. Στο επιστημονικό του έργο περιλαμβάνονται άρθρα σε διεθνή περιοδικά, βιβλία και παρουσιάσεις σε συνέδρια.